"Ваши пришельцы, агент Малдер, ваши маленькие зеленые человечки приземлились здесь миллионы лет назад.."
Англичанин

Настоящая ценность сериала "Секретные материалы", по словам его же создателя, заключается в мифологии. Именно благодаря этому эпопея обрела небывалую популярность.

Уже первые серии (пилотный фильм, 1х00; "Бездонная Глотка", 1х01) положили начало основной сюжетной линии сериала - заговор с целью сокрытия факта вторжения инопланетян-колонистов. 1 серия заставляет нас призадуматься: зачем Курильщик собирает инопланетные имплантанты в хранилищах Пентагона? Позже мы понимаем, что некоторые микрочипы (имплантанты) не такие уж и инопланетные. 2 серия показывает, что военные заинтересованы проблемой НЛО и что они, используя внеземную технологию, пытаются создать свои, земные неопознанные объекты.

Эта же серия положила начало теории заговора против американского народа. Нам становится интересно: а что будет дальше? К чему все это приведет? Крис Картер тогда даже не предполагал насколько простую идею он превратит в запутанный, хитроумный и оригинальный сюжет. В начале все было просто: есть пришельцы, похищающие людей и военные, которые пытаются освоить внеземные технологии. Но затем выясняется, что здесь, между ними, может быть кое-какая связь. И на протяжении всех сезонов понимаешь, что это не просто "кое-какая связь". Все гораздо сложнее...

Миллионы лет назад инопланетяне лишились своего Солнца, превратившегося в Сверхновую, и вынуждены были покинуть свою планету. Обладая высокой приспособляемостью, они могли колонизировать любую планету, но единственным условием для колонизации было наличие на планете разумных форм жизни или предпосылок к ее возникновению. Таких планет нашлось несколько и на всех пришельцы посеяли свою культуру. И за много тысяч лет до появления человека Земля была "засеяна" для будущей колонизации. Колонисты решили, что удобнее приспособить для своих нужд миры, где уже есть развитые цивилизации, чем обустраиваться самим, т.е. начать все с начала. Однако, миллионы лет назад, в Ледниковый период колонистам пришлось оставить Землю и отложить колонизацию. Но пришельцы оставили небольшое "сообщение" под землей - развитую форму "черного рака", своей жизненной силы. Другая часть колонистов остались в огромном космическом корабле, замурованным во льдах Антарктиды. ("Fight the future"). По окончанию Ледникового периода инопланетяне вернулись и вели наблюдение за развивающейся расой . В 1973 году они вступили в контакт с земным правительством, члены которого входили в секретную организацию - Консорциум. Приблизительно в это же время был заключен союз колонистов с Консорциумом. При контакте пришельцы сообщили цель своего визита - Колонизация с постепенным внедрением инопланетян в жизнь людей. Консорциум должен был подготовить колонизацию, занимаясь созданием гибрида инопланетянина и человека, который имеет иммунитет против вируса "черного рака". А члены секретной организации, после завершения работ по созданию гибрида, должны будут сами стать гибридами, что бы выжить во время колонизации. Что бы гарантировать подчинение членов Консорциума, колонисты потребовали отдать им одного из члена их семей, которые будут возвращены к окончанию работы по созданию гибрида.

Консорциум собирает данные ("Операция "Скрепка") на людей с целью создания клонов-гибридов. Это был приказ колонистов, которые дали Консорциуму инопланетный эмбрион ("Колба Эрленмейера") как источник ткани для эксперементов. Программа клонирования тоже была важной частью в колонизации, т.к. человеческие клоны и клоны гибридов тоже имели иммунитет против "черного рака". Однако отец Малдера, участвующий в этом Проекте, был против союза. Еще в 1973 он предлагал сопротивление, но к нему никто не прислушался. Сопротивление стало возможным, когда появились гуманоиды-мятежники, но и тогда все закончилось ничем. В результате борьбы колонистов с мятежниками погибли только люди ("Пациент Х", "Красное и черное"). Не смотря на это Биллу Малдеру пришлось пожертвовать членом своей семьи - своей дочерью Самантой. Он позволил им похитить сестру Фокса Малдера, чтобы ее использовали в программе клонирования, что бы она осталась в живых хотя бы в качестве генетического гибрида. На своего сына он возлагал надежду на то, что он сможет узнать всю правду об этом Проекте, что он сможет остановить колонизацию и сразиться с будущим ("Битва с будущим").

Зачем же пришельцам создавать гибрид? Здесь все очень просто - чтобы получить расу рабов, имеющих повышенную работоспособность, выносливость и высокий иммунитет против всех болезней. Видимо, при помощи этих гибридов, инопланетяне собираются перестроить Землю под свои стандарты.

Параллельно с разработкой гибрида земные ученые, входящие в Консорциум, создавали вакцину против "черного рака", с помощью которого колонисты переселятся сюда. Когда наступит время колонизации, "черный рак" начнут распространять более эффективным и быстрым способом. Специально выведенные пчелы, используя пыльцу со специально выращенного зерна кукурузы, будут распространять черный рак посредством своих жал. Этот метод был испробован Синдикатом с использованием вируса "черной оспы" вместо черного рака. Программа вакцинации от этой самой оспы была прикрытием для проекта Синдиката по каталогизации населения США. В результате проведения этой программы Синдикатом были получены образцы ДНК каждого американца, которые стали уникальными идентификаторами. Это гарантирует, что все население (по крайней мере в США) будет на строгом учете после начала колонизации. Клоны тоже идентифицируются подобным образом. Вот для чего люди в окрестностях Тунгусского лагеря отрезают себе левые руки (на них делалась прививка от оспы) - они не смогут тестироваться черным маслом. Когда начнется колонизация, только Федеральное управление по чрезвычайным ситуациям США (Federal Emergency Management Agency) будет контролировать ситуацию, так как эпидемии входят в их юрисдикцию. Поскольку FEMA подчиняется Синдикату, то ситуация будет в руках тех, кто за этим стоит. В день начала колонизации президентом будет объявлено о чрезвычайном положении и управление страной перейдет к FEMA. (Talitha Cumi, Herrenvolk, Zero Sum, Fight the Future) Эксперементы по созданию вакцины начались еще в 1908 году, когда русские обнаружили на месте падения Тунгусского метеорита черную жидкость. В течении всего этого времени вакцина находилась в стадии разработки. В 1996 году русские добились небольшого успеха и агент Крайчек выкрал экзепляр для дальнейших опытов в Америке. Доказательства того, что вакцина работает - выжывание Мариты Коваррубиас, над которой ставили эксперементы с вакциной, заразив ее "черным раком".

Следуя соглашению, колонизация начнется, когда будет создан успешный гибрид инопланетянина и человека. Консорциум "тормозил" эту работу, дабы оттянуть колонизацию и потратить больше времени на разработку вакцины. Однако в феврале 1999 года впервые был создан успешный гибрид - Кассандра Спендер. А это означало начало колонизации. Соглашению заключалось в том, что когда будет создан успешный гибрид, Консорциум вернет колонистам эмбрион и получат гены гибрида, чтобы выжить в холокостье. К тому же колонисты узнали о существовании вакцины ("Битва с будущим"), что ускорило колонизацию.

После того, как колонизации был нанесен огромный ущерб посредством уничтожения большинства членов Консорциума и первого удачного гибрида, пришельцы изменили стратегию. Теперь их план состоял в том, чтобы полностью заменить человечество на инопланетных универсальных солдат, предварительно внедряя этих же солдат в структуру власти. Похищая определенную группу людей, они проводили над ними более сложные и жестокие операции, нежели ранее. В организм похищенного человека внедрялся вирус (была ли это новая форма «черного рака» или нет – неизвестно), изменялась костная система, внедрялись чипы. Образовывалась не только «стальная» основа скелета, но и система самовосстановления. После того, как вся земная власть будет заменена суперсолдатами, наступит начало колонизации. Люди, замененные на суперсолдат останутся в живых как рабочая сила.
В первую очередь подвергнуты «перерождению» были те самые «избранные», люди, которые не только неоднократно побывали у пришельцев, но и представляли из себя что-то подобие гибридов, имея иммунитет к вирусу «черного рака».
И теперь уже нам открыли лицо истинных колонистов. Ими оказались… Мятежники, те самые безликие пришельцы, которые сжигали «избранных» и сожгли членов Консорциума. Это означает, что шла борьба за Землю между Мятежниками и колонистами, серыми гуманоидами. Отсюда же вытекает предположительная «смена» стратегии колонистов – это была вовсе не смена, а план другой расы.
Однако обнаружилась слабость суперсолдат – они разрушаются, сливаясь с первоосновой, заключенной в железистых соединениях каньона из эпизода «Не верь никому».

Зерна, точнее сказать, споры пришельцев представляют собой вирус. Споры объединяются в некую самостоятельную субстанцию, которая способна передвигаться и нападать ("черный рак"). Эта черная субстанция способна адаптироваться к изменению климатических, атмосферных и прочих условий. Попадая в питательную среду (например, в организм человека), вирус начинает энергично развиваться, превращаясь в паразита. В этом состоянии он завладевает мозгом своей жертвы, прикрепляясь к шишковидной железе, и может манипулировать его поведением ("Пайпер Мару", "Апокриф"). Эта стадия развития инопланетян была известна Консорциуму. Однако в 1998 году они понимают, что колонисты от них тоже кое-что скрывали: вторую стадию развития. Паразитирующая в организме человека черная жидкость, может развиваться дальше, усваивая ткани и кости "хозяина". Постепенно "черный рак" полностью высасывает все питательные вещества из организма, вырастая из "икринки" в "головастика" - т.е. достигает промежуточной стадии между зародышем и взрослой особью. Узнав о этой стадии, члены Консорциума поняли, что в Колонизации вымрут все (за исключением их, конечно же). Но появляется вероятность, что этот вид мутировавшегося (под воздействием тепла) "черного рака" может убить даже гибридов. Иначе почему Консорциум так заволновался, ведь выживание - их главная идеология. Пребывая в организме, "черный рак" постепенно формируется в зародыша, который в свою очередь и превращается в нечто среднее между первой и третей стадиями развития. Это - существо, не обладающее интеллектом. Его единственное умение - убивать. Но инстинктивно он ищет тепло, которое поможет ему развиться окончательно.

И именно благодаря теплу инопланетянин переходит в свою последнюю, третью, стадию развития. Находясь в тепле, пришелец впадает в спячку на некоторое время, после чего у него происходит линька - с существа спадает его кожа, под которой и кроется истинный облик инопланетянина. ("Битва с будущим", "Начало").

И эта взрослая особь - существо с высоким уровнем интеллекта, превосходящим человеческий. Внешне оно так же отличается от своей личинки, как бабочка от гусеницы.

Еще одна особенность: на всех стадиях развития пришельцы способны координировать свою деятельность. Т.е. возможно, что колонисты тайно посылали сигналы вирусу "черного рака", котоый вследствии заложенной в сигнал информации ппродолжал свое развитие в телах людей.